More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1474 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  53.65 
 
 
187 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  54.97 
 
 
186 aa  197  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  46.47 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  45.14 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  44.65 
 
 
176 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 
175 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  39.77 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  41.57 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 
176 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.08 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.92 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  43.09 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 
174 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.5 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.5 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  37.57 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  39.31 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
176 aa  111  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
178 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.56 
 
 
173 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 
174 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.95 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 
172 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 
174 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 
174 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.14 
 
 
178 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.91 
 
 
173 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.95 
 
 
183 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
172 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.2 
 
 
176 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
174 aa  101  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
179 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
179 aa  101  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.36 
 
 
174 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  35.76 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  36.6 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  35 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
171 aa  95.5  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  40.24 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  40.24 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  37.93 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 
174 aa  92  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.29 
 
 
256 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  31.49 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  35.23 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 
170 aa  89  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  35.37 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
189 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.15 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  34.01 
 
 
166 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 
173 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  35.67 
 
 
174 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  33.89 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  35.37 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  37.06 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  36.48 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 
228 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  38.36 
 
 
202 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.36 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  37.02 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 
173 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>