More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1281 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  100 
 
 
503 aa  1022    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  58.45 
 
 
503 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  53.02 
 
 
495 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  54.56 
 
 
516 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  45.79 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  42.59 
 
 
436 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  41.47 
 
 
400 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  26.55 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.1 
 
 
475 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  28.81 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  41.61 
 
 
412 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  32.03 
 
 
440 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  40.58 
 
 
372 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  36.42 
 
 
446 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  23.95 
 
 
407 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  40.58 
 
 
372 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  40.58 
 
 
373 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.88 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  31.32 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  23.83 
 
 
417 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  28.63 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.38 
 
 
455 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  24.52 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.17 
 
 
387 aa  94  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  33.58 
 
 
430 aa  90.5  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  28.83 
 
 
397 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  29.6 
 
 
416 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  33.91 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  35.42 
 
 
388 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.9 
 
 
438 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.92 
 
 
428 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.11 
 
 
438 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  34.5 
 
 
481 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  29.52 
 
 
438 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  29.24 
 
 
394 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  30.11 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  38.81 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.84 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  34.33 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.67 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.61 
 
 
303 aa  84  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  23.45 
 
 
456 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  37.31 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.92 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.45 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  35.21 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  36.64 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  35.03 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  36.57 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.78 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  33.33 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  36.28 
 
 
304 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  35.97 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  36.57 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  36.15 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  36.75 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.97 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  34.33 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  36.84 
 
 
247 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  35.21 
 
 
382 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  27.96 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  27.96 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  35.82 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  33.99 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  43.59 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  27.42 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  39.39 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.51 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  27.34 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  27.54 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  27.42 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  27.54 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  36.84 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  33.07 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  37.23 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  31.68 
 
 
412 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  27.63 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  27.63 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  33.62 
 
 
247 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  34.68 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32.58 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.27 
 
 
472 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  33.86 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  36.8 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  30.27 
 
 
472 aa  72  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  28.34 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  33.86 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  25.22 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  34.35 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1979  peptidase M23B  35.54 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552283  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  35.77 
 
 
530 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  37.1 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  33.54 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  35.66 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  37.1 
 
 
538 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  26.11 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  33.33 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  39.18 
 
 
250 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  33.58 
 
 
379 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  40.94 
 
 
240 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>