More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6150 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  100 
 
 		 391 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3093  Citrate (Si)-synthase  66.67 
 
 		 378 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  66.22 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3748  Citrate (Si)-synthase  57.03 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1729  Citrate (Si)-synthase  51.6 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  42.47 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2557  citrate synthase  43.85 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  41.76 
 
 		 375 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.43 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.32 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2423  Citrate (Si)-synthase  40.75 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.17 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2539  Citrate (Si)-synthase  41.03 
 
 		 374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.64966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  37.82 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.43 
 
 		 378 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.26 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  38.65 
 
 		 375 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  38.38 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  38.26 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  37.93 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  37.85 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  35.68 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  37.63 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.25 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  37.93 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.52 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.52 
 
 		 367 aa  236  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.05 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  37.6 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  36.9 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  36.9 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.8 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  37.87 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  38.13 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  36.9 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  37.6 
 
 		 381 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.44 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  36.63 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1063  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  38.24 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.75 
 
 		 387 aa  230  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  38.52 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  37.6 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.5 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.73 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  38.73 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  37.14 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  36.9 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  37.33 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10908  citrate synthase 2  39.24 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.99 
 
 		 409 aa  229  8e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  36.29 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  36.34 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0733  citrate synthase 2  39.05 
 
 		 368 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  37.27 
 
 		 382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0520  citrate (Si)-synthase  39.24 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341938  normal  0.0162418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0834  Citrate (Si)-synthase  37.47 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1665  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.58 
 
 		 374 aa  226  7e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  34.04 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  37.53 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1347  methylcitrate synthase  36.76 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0830  Citrate (Si)-synthase  38.48 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2821  putative 2-methylcitrate synthase  34.06 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.702751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  34.21 
 
 		 391 aa  222  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2498  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.79 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0246552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2604  2-methylcitrate synthase  36.47 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121252  hitchhiker  0.000290432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4790  methylcitrate synthase  36.6 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  0.159071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  35.17 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.68 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1821  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4841  methylcitrate synthase  34.55 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.994856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5388  methylcitrate synthase  34.55 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1858  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  34.88 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0621  methylcitrate synthase  34.36 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0142  methylcitrate synthase  34.81 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0511  citrate synthase 2  36.49 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.043222  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  36.24 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  37.96 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0848  Citrate (Si)-synthase  37.14 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3288  methylcitrate synthase  34.81 
 
 		 390 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281405  normal  0.014196 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  33.95 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4756  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.394349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5345  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5516  methylcitrate synthase  34.2 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  36.61 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1868  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.96 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.650369  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2112  2-methylcitrate synthase  33.24 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  36 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  34.85 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  34.85 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0878  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1869  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2142  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1165  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0289  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1737  methylcitrate synthase  34.63 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>