More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5649 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
343 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  58.67 
 
 
339 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  57.97 
 
 
339 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  54.91 
 
 
352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  51.97 
 
 
352 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
339 aa  348  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  50 
 
 
347 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  51.15 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  51.15 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  54.6 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  50.86 
 
 
343 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  54.31 
 
 
341 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  50.86 
 
 
343 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  49.71 
 
 
343 aa  332  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  52.01 
 
 
372 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  49.43 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  51.79 
 
 
361 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  50.44 
 
 
346 aa  305  8.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  48.74 
 
 
359 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  45.48 
 
 
372 aa  279  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  43.24 
 
 
349 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  49.01 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  45.17 
 
 
346 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  45.94 
 
 
349 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  45.94 
 
 
349 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  44.71 
 
 
344 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  45.94 
 
 
349 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  43.37 
 
 
348 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  44.88 
 
 
346 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  44.72 
 
 
344 aa  257  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
346 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  43.11 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  43.6 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  42.6 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  45.6 
 
 
346 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  43.11 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  41.88 
 
 
351 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.47 
 
 
361 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  44.41 
 
 
345 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  45.05 
 
 
346 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  43.56 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.48 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  41.52 
 
 
350 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  43.77 
 
 
355 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  42.22 
 
 
342 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  37.31 
 
 
354 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  39.93 
 
 
349 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  39.93 
 
 
349 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  33.72 
 
 
336 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.31 
 
 
336 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.64 
 
 
333 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.22 
 
 
332 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.89 
 
 
334 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 
335 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  29.62 
 
 
321 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.84 
 
 
318 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  37.63 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.33 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.65 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
327 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  26.91 
 
 
341 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.05 
 
 
328 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.59 
 
 
328 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  26.11 
 
 
357 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.5 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.66 
 
 
333 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  27.08 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  36.53 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.51 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.29 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.46 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 
349 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.77 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.28 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.43 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.43 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.43 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  26.78 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  26.82 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  29.82 
 
 
348 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  26.13 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  34.18 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.04 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.85 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  32.78 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  35.59 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  27.54 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  33.89 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.63 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  28.14 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.35 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  29.46 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.94 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  29.46 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.32 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  26.49 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>