More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2398 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
282 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  40.55 
 
 
258 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 
234 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  29.1 
 
 
286 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
287 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.54 
 
 
279 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
265 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.52 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.78 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
259 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
279 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.89 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.5 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  29.41 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.02 
 
 
296 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.02 
 
 
296 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
323 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
326 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
283 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  29.02 
 
 
296 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.46 
 
 
262 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
279 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
270 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
287 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
425 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
270 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 
268 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.68 
 
 
272 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  28.03 
 
 
219 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
267 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.34 
 
 
263 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
270 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
270 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
271 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.86 
 
 
281 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
284 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
270 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
261 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
261 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
270 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  29.35 
 
 
233 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.86 
 
 
233 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
273 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
226 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.83 
 
 
258 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.59 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
259 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
267 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
310 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.49 
 
 
571 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
267 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
265 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
272 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
255 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
273 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.24 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.97 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
270 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  41.74 
 
 
278 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>