More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0621 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.18611e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  7.3544e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  61.5 
 
 
217 aa  274  8e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  8.68379e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  61.95 
 
 
212 aa  271  8e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  63.05 
 
 
211 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  63.05 
 
 
211 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  60.49 
 
 
210 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  59.31 
 
 
212 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  58.82 
 
 
212 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  59.31 
 
 
212 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.91421e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  58.33 
 
 
215 aa  262  5e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  58.33 
 
 
212 aa  262  5e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  58.79 
 
 
224 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  61.5 
 
 
208 aa  258  9e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  50.61 
 
 
267 aa  251  9e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.63425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  57.29 
 
 
223 aa  250  1e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  62.56 
 
 
211 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  55.28 
 
 
226 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.50379e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  51.6 
 
 
191 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  40.31 
 
 
271 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  41.41 
 
 
216 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  164  2e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  164  2e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  40.1 
 
 
216 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  40.1 
 
 
216 aa  164  2e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  39.8 
 
 
216 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  41.33 
 
 
216 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  39.59 
 
 
216 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  39.59 
 
 
216 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  40.96 
 
 
274 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  41.03 
 
 
313 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.13301e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  37.88 
 
 
239 aa  155  5e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  39.78 
 
 
204 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  31.3 
 
 
250 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  31.19 
 
 
247 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  37.97 
 
 
290 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  37.04 
 
 
277 aa  140  2e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  37.5 
 
 
261 aa  140  2e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  34.95 
 
 
256 aa  138  8e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  30.88 
 
 
223 aa  136  3e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  39.34 
 
 
249 aa  132  4e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  34.76 
 
 
230 aa  131  1e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.1111e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35.29 
 
 
224 aa  130  2e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  37.65 
 
 
246 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  35.93 
 
 
269 aa  121  1e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  35.26 
 
 
229 aa  121  1e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  37.42 
 
 
203 aa  119  5e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.32311e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  32.48 
 
 
247 aa  118  1e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  35.71 
 
 
208 aa  113  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  31.22 
 
 
233 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  32.28 
 
 
230 aa  110  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  32.28 
 
 
230 aa  110  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  27.23 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  27.85 
 
 
337 aa  70.9  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  27.43 
 
 
362 aa  68.2  1e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  33.04 
 
 
340 aa  57.4  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  29.05 
 
 
366 aa  57.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  4.08505e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  28.14 
 
 
738 aa  57  3e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.78935e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  27.54 
 
 
739 aa  56.6  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.45051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  32.84 
 
 
388 aa  56.6  4e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  6.26045e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  26.74 
 
 
356 aa  56.2  5e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  27.27 
 
 
356 aa  56.2  5e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03528  GTP pyrophosphokinase  27.98 
 
 
739 aa  55.5  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.58 
 
 
744 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.58 
 
 
744 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.58 
 
 
744 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  28.66 
 
 
329 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  28.28 
 
 
750 aa  54.3  2e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  27.91 
 
 
362 aa  54.3  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.55841e-34 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.58 
 
 
744 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  4.0075e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  32.58 
 
 
744 aa  54.3  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.54 
 
 
727 aa  54.3  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1758  GTP diphosphokinase, RelA/SpoT protein  26.71 
 
 
722 aa  54.7  2e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.76617  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.71 
 
 
745 aa  54.3  2e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.21392e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  27.69 
 
 
359 aa  53.9  3e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.11353e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.60798e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0928  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.82583e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3089  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.4869e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.09177e-07  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  27.38 
 
 
745 aa  53.9  3e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  27.75 
 
 
359 aa  53.5  3e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.04096e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  3e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  8.29976e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0214  RelA/SpoT domain-containing protein  25.39 
 
 
353 aa  53.5  4e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000343543  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  4e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.88713e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.89 
 
 
744 aa  53.1  4e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 
744 aa  53.5  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.6084e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  30.89 
 
 
745 aa  53.1  5e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  4.88354e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  28.25 
 
 
369 aa  53.1  5e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0105  RelA/SpoT domain-containing protein  28.28 
 
 
368 aa  52.8  5e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  29.07 
 
 
748 aa  53.1  5e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>