144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04130 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  39.81 
 
 		 1459 aa  976    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  100 
 
 		 1485 aa  3074    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  34.85 
 
 		 1463 aa  795    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  36.62 
 
 		 990 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  27.89 
 
 		 780 aa  199  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  27.89 
 
 		 780 aa  198  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  27.44 
 
 		 810 aa  191  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  28.32 
 
 		 781 aa  188  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  24.77 
 
 		 941 aa  183  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  25.83 
 
 		 783 aa  180  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  26.32 
 
 		 932 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  27.43 
 
 		 785 aa  178  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  26.62 
 
 		 811 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.68 
 
 		 910 aa  173  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.47 
 
 		 781 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  24.22 
 
 		 982 aa  168  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  26.37 
 
 		 1058 aa  166  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  25.37 
 
 		 784 aa  166  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  25.9 
 
 		 786 aa  165  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.65 
 
 		 1044 aa  163  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  25.65 
 
 		 794 aa  158  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  24.61 
 
 		 1087 aa  155  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  24.62 
 
 		 1070 aa  154  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  25.92 
 
 		 786 aa  143  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  25.31 
 
 		 821 aa  142  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  24.04 
 
 		 783 aa  139  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  24.07 
 
 		 929 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  25.63 
 
 		 784 aa  135  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  26.28 
 
 		 795 aa  134  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  24.25 
 
 		 796 aa  131  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  29.95 
 
 		 853 aa  127  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 795 aa  127  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 794 aa  125  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  23.49 
 
 		 795 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.98 
 
 		 789 aa  124  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  24.73 
 
 		 809 aa  123  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.33 
 
 		 789 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  23.29 
 
 		 912 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25.2 
 
 		 793 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 853 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.96 
 
 		 818 aa  121  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  23 
 
 		 791 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  29.66 
 
 		 607 aa  121  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  30.27 
 
 		 854 aa  120  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 816 aa  119  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  23.88 
 
 		 792 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.44 
 
 		 812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 816 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  29.44 
 
 		 871 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  29.59 
 
 		 854 aa  116  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  27.74 
 
 		 792 aa  115  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 852 aa  115  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 789 aa  115  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  23.49 
 
 		 821 aa  115  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 789 aa  115  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 789 aa  115  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  25.42 
 
 		 790 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  24.48 
 
 		 788 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  25.26 
 
 		 787 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 786 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.8 
 
 		 783 aa  113  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  28.03 
 
 		 799 aa  113  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 791 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.71 
 
 		 783 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  22.94 
 
 		 788 aa  112  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  25.68 
 
 		 810 aa  112  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  26.49 
 
 		 808 aa  112  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  26.35 
 
 		 810 aa  112  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.08 
 
 		 807 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  28.95 
 
 		 835 aa  111  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  24.61 
 
 		 790 aa  111  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  23.56 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  23.65 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  23.94 
 
 		 787 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.91 
 
 		 788 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  23.39 
 
 		 820 aa  110  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  23.56 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  23.65 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  23.26 
 
 		 787 aa  110  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  23.65 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.95 
 
 		 787 aa  110  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 787 aa  109  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  25.93 
 
 		 810 aa  109  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  23.49 
 
 		 783 aa  109  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  25.34 
 
 		 788 aa  109  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  26.3 
 
 		 809 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  25.94 
 
 		 809 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  22.34 
 
 		 793 aa  108  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  25.48 
 
 		 797 aa  108  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.1 
 
 		 783 aa  108  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  25.81 
 
 		 809 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  24.18 
 
 		 786 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  24.23 
 
 		 786 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.6 
 
 		 787 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 783 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.1 
 
 		 783 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  26.98 
 
 		 801 aa  107  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  26.21 
 
 		 809 aa  107  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  22.5 
 
 		 818 aa  106  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  23.24 
 
 		 783 aa  106  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>