More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0291 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  97.71 
 
 
393 aa  798    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  100 
 
 
393 aa  811    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  84.91 
 
 
392 aa  695    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  98.47 
 
 
393 aa  802    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  70.48 
 
 
396 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  71.47 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  69.21 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  68.7 
 
 
396 aa  571  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  67.87 
 
 
396 aa  559  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  60.88 
 
 
404 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.72 
 
 
402 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.83 
 
 
407 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  43.04 
 
 
393 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  43.31 
 
 
396 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  44.68 
 
 
398 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.09 
 
 
384 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  43.99 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.46 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.1 
 
 
389 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  43.46 
 
 
400 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  42.64 
 
 
402 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.78 
 
 
394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.99 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  40.89 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.92 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.1 
 
 
391 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  42.49 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  42.15 
 
 
389 aa  305  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  41.73 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.26 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.38 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  42.15 
 
 
382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  41.15 
 
 
391 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.21 
 
 
400 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.26 
 
 
400 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  41.99 
 
 
401 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  41.99 
 
 
401 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.52 
 
 
392 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 
401 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.16 
 
 
399 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 
388 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.93 
 
 
394 aa  296  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.74 
 
 
379 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  41.45 
 
 
403 aa  295  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  43.6 
 
 
387 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  43.86 
 
 
388 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  42.41 
 
 
407 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.56 
 
 
396 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.73 
 
 
398 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 
410 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  41.45 
 
 
405 aa  292  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  43.6 
 
 
387 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  41.88 
 
 
397 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  38.9 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  42.41 
 
 
407 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.01 
 
 
398 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.01 
 
 
398 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  41.41 
 
 
386 aa  287  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.01 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.32 
 
 
394 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.78 
 
 
383 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  39.74 
 
 
417 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  39.9 
 
 
398 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 
388 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.27 
 
 
399 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.85 
 
 
389 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  41.49 
 
 
394 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 
388 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.26 
 
 
396 aa  276  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.57 
 
 
404 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.53 
 
 
400 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  43.12 
 
 
404 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  40.37 
 
 
384 aa  275  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.54 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  40.64 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.74 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.05 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  37.76 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.11 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  39.12 
 
 
405 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 
402 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.85 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.8 
 
 
403 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.5 
 
 
388 aa  268  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  41.62 
 
 
400 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  38.4 
 
 
407 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  38.14 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  40.41 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  40.67 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.44 
 
 
407 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  38.44 
 
 
407 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  40.16 
 
 
419 aa  266  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  38.44 
 
 
407 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.89 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  38.44 
 
 
407 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>