More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2703 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.76 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.29 
 
 		 137 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  69.4 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.52 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  60.29 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.74 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.28 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 173 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.04 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  54.81 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 141 aa  146  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  46.26 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 147 aa  141  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.11 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.49 
 
 		 152 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 191 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  54.69 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 		 193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 		 193 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 193 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.15 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.85 
 
 		 150 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.41 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  49.22 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  45.65 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.75 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.63 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.51 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 150 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.12 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  44.44 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  45.59 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>