More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0916 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  100 
 
 		 462 aa  902    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  58.24 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  50.85 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  46.91 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  48.53 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  45.49 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  48.51 
 
 		 515 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  48.51 
 
 		 515 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  48.6 
 
 		 446 aa  359  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  50.36 
 
 		 497 aa  359  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  47.52 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  51.43 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  51.04 
 
 		 507 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  51.04 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  50 
 
 		 509 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  47.45 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  51.16 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  48.55 
 
 		 525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  48.58 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  47.36 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  46.88 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  45.83 
 
 		 435 aa  329  8e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  45.83 
 
 		 435 aa  329  8e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  43.78 
 
 		 511 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  47.85 
 
 		 489 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  47.63 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  49.38 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  47.84 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  44.42 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  44.42 
 
 		 486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  45.94 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  43.65 
 
 		 445 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  44.42 
 
 		 486 aa  319  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  47.13 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  44.53 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  44.27 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  44.27 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  44.39 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  49.02 
 
 		 488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  45.79 
 
 		 441 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  46.47 
 
 		 478 aa  312  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  44.87 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  44.87 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  48.23 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  46.27 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  44.15 
 
 		 416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  43.91 
 
 		 416 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  43.91 
 
 		 416 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  43.91 
 
 		 416 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  45.99 
 
 		 416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  43.44 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  46.92 
 
 		 478 aa  308  9e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  43.44 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  43.94 
 
 		 416 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  42.29 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  43.68 
 
 		 416 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  46.05 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  44.31 
 
 		 487 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  39.42 
 
 		 469 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  45.22 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  46.23 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  44.37 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  45.52 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  42.32 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  43.88 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  45.45 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  46.7 
 
 		 441 aa  296  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  49.51 
 
 		 442 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  44.29 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  45.74 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  47.39 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  44.76 
 
 		 414 aa  289  8e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  40.85 
 
 		 644 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  44.55 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  42.69 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  45.82 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  42.04 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  45.28 
 
 		 421 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  42.04 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  41.36 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  46.21 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  43.68 
 
 		 439 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  41.77 
 
 		 1322 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  42.99 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  45.02 
 
 		 416 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  43.97 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.53 
 
 		 1016 aa  276  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  47.49 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  41.32 
 
 		 407 aa  274  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  41.49 
 
 		 1209 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  44.66 
 
 		 415 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.95 
 
 		 1262 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  43.68 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 717 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.81 
 
 		 1018 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  40.63 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  42.21 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.9 
 
 		 1264 aa  263  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0136  putative ammonium transporter  44.98 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000107717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  40.35 
 
 		 611 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>