More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0516 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  63.25 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  60.33 
 
 		 296 aa  345  7e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  48.42 
 
 		 285 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  38.91 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  42 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  41.89 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  41.13 
 
 		 344 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  38.34 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  38.34 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  39.5 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  39.93 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  41.07 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  40.71 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  34.44 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.22 
 
 		 345 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  35.59 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  38.08 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  35.31 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  35.23 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  39.06 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  33.81 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  57.32 
 
 		 469 aa  193  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.06 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.19 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  34.77 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  30.85 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.86 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  30.25 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 323 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  29.43 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  32.86 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  28.04 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.42 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  31.42 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  32.22 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.59 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  32.59 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  32.59 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  32.22 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.13 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  30.96 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  31.23 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  33.73 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  30.86 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.52 
 
 		 514 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  32.82 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.36 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  26.83 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  24.16 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  31.58 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  28.18 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  24.66 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  28.72 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  26.79 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.91 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  26.85 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  25.26 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.36 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  30.37 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.37 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.37 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.37 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  26.62 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>