More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0377 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  62.39 
 
 		 227 aa  295  3e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  62.22 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  62.67 
 
 		 226 aa  288  7e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  61.33 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  61.43 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  59.17 
 
 		 226 aa  264  7e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  37.44 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  32.14 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  31.65 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  32.09 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  34.07 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.58 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  32.72 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  29.02 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  33.8 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  31.36 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  33.33 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  30.91 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  27.98 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  30.67 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  32.87 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  29.77 
 
 		 214 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  32.58 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 476 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.66 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  31.67 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0176  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_166  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 517 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  28.9 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 953 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  31.84 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  29.83 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  30.45 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000725059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  30.26 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 502 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  31.6 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  29.36 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0177  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  29.77 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.82 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 243 aa  101  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.15 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 636 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.6 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>