More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0034 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0034  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000482612  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1032  50S ribosomal protein L3  79.17 
 
 		 192 aa  323  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2326  50S ribosomal protein L3  78.12 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000428305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0059  50S ribosomal protein L3  76.56 
 
 		 191 aa  308  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  6.39539e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1875  50S ribosomal protein L3  76.04 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.000188213  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0001  50S ribosomal protein L3  76.04 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000708799  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2081  50S ribosomal protein L3  76.04 
 
 		 191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.00000000000497274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0084  50S ribosomal protein L3  71.88 
 
 		 191 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000354525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1968  50S ribosomal protein L3  68.23 
 
 		 192 aa  280  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000162789  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0286  50S ribosomal protein L3  65.62 
 
 		 191 aa  263  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00181466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  38.92 
 
 		 207 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  38.92 
 
 		 207 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  38.34 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  39.2 
 
 		 214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  38 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  37.56 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  34.67 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  37.5 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  37.19 
 
 		 214 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  37.88 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  37.06 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  35.71 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 212 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  39.8 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  38.5 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  37.06 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  36.36 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  38.58 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  37.63 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  37.63 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  35.5 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  35.5 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  35.5 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  38.46 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  35.29 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  37.24 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  37.24 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  35.82 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  35.29 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  35.2 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  39.58 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  36.92 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  35.53 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  35.53 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  36.04 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  36.98 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  36.22 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  35.32 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  36.79 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  36.04 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  39.04 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  36.04 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0323  50S ribosomal protein L3  33.68 
 
 		 214 aa  101  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000334047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  35.94 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  35.64 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  35 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  34.16 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  34.5 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  37.31 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  36.27 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  36.5 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  36.6 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 211 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  34.54 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  35.35 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  35.86 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  35.64 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  36.27 
 
 		 216 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  38.02 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  36.84 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  36.65 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  34.85 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  35.05 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.63 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  37.57 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  37.11 
 
 		 212 aa  98.6  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  36.32 
 
 		 242 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  35.35 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  35.57 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  36.55 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  37.31 
 
 		 211 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  35.23 
 
 		 217 aa  97.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  34.5 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  34.54 
 
 		 218 aa  97.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  48 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  37.81 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>