More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1869 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  64.19 
 
 		 231 aa  311  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  38.07 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  31.94 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  34.09 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  31.36 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  29.86 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.27 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  29.38 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  30.52 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  27.43 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  27.23 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.37 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  28.84 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  34.58 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  28.82 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  26.24 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  28.96 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.65 
 
 		 219 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  30.59 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.82 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.36 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  28.04 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  28.77 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.07 
 
 		 279 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.61 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.42 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  31.8 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  30 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  28.82 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  25.94 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  27.4 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.55 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  26.94 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.79 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  25.94 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  29.91 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  28 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  25.94 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.5 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  27.19 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  26.99 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  31.8 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  33.49 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  27.75 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  26.55 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.98 
 
 		 635 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.79 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  28.32 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.31 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  29.28 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  30.19 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.85 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  30.41 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.91 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  31.63 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  31.06 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  26.73 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.44 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.73 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  30.84 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  27.19 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  27.4 
 
 		 799 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  25.94 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.51 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.55 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.86 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.74 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.73 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>