More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2115 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2115  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2143  transcriptional regulator, LysR family  95.24 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2218  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.573789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3369  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2547  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291089  decreased coverage  0.00703073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44180  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3168  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.655223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3758  putative transcriptional regulator  40.69 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3681  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2552  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0485  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3528  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3199  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3084  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115544  normal  0.0198492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2210  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0327  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47310  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1835  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2144  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3146  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4082  putative transcriptional regulator  35.04 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2533  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3166  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3460  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143807  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3254  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819694  normal  0.147179 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29540  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 286 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3260  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.670628  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5370  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.626785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6501  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711222  normal  0.162689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5138  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5011  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.967403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5518  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.593502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3682  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.903074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2407  MarR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.565631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4611  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.144049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4477  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861356  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1695  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.909005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5191  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4288  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.423442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1421  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2677  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0133  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4470  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0844089  normal  0.102172 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4604  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  33.05 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4191  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0178  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2996  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.563844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1279  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3147  LysR, substrate-binding  28.67 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.873813  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  30.51 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  26.27 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0660  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7527  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  28.45 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  26.27 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1255  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>