More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1820 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  85.38 
 
 		 260 aa  470  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  70.93 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  68.87 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  70.43 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  70.43 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  68.6 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  67.7 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  70.47 
 
 		 258 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  66.93 
 
 		 256 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  63.81 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  64.09 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  55.72 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  56.02 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  57.2 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  55.26 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  56.77 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  57.47 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  57.09 
 
 		 258 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  57.92 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  57.09 
 
 		 258 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  57.14 
 
 		 258 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  56.32 
 
 		 258 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  54.47 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  55.98 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  55.64 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  55.64 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  57.53 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.14 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  57.14 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  54.14 
 
 		 265 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  53.31 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  55.6 
 
 		 271 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  55.6 
 
 		 271 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  53.7 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  49.64 
 
 		 282 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  50.71 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  53.1 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  53.08 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  54.9 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  53.1 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  55.43 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  55.04 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  51.36 
 
 		 254 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  48.45 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  48.06 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  48.15 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  47.73 
 
 		 260 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  52.71 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  52.71 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  48.32 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  46.92 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  46.79 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  48.84 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  46.59 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  46.62 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  42.44 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  44.98 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  44.98 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 		 275 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  41.57 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  45.52 
 
 		 282 aa  222  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  41.2 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  42.54 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  40.37 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  44.07 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  40.54 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.53 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  40.15 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  39.77 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  38.61 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  34.88 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  39.77 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  39.23 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  38.37 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  39.08 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  39 
 
 		 276 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  39.38 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  38.22 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  40.23 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  37.93 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  38.13 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  37.07 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.93 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0675  exodeoxyribonuclease III  35.38 
 
 		 281 aa  181  8.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107108  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  41.86 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  39.39 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  37.98 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>