80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1667 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  92.23 
 
 		 283 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  72.08 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  52.08 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  49.65 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  47.39 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  47.74 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  47.74 
 
 		 495 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  47.74 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  47.74 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  47.74 
 
 		 274 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  47.39 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  43.87 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  43.26 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  43.26 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  39.44 
 
 		 272 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  42.91 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  43.77 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  42.91 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  41.75 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  42.26 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  37.63 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  40.62 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  37.72 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  37.72 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  37.63 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  40.78 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  40.23 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.31 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  50.35 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  37.86 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  38.38 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.63 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  37.4 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  34.72 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  33.94 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  42.48 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.49 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  34.86 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  31.77 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  50.4 
 
 		 126 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  35.21 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  36.4 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  35.25 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  36.67 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  38.01 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  34.35 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  43.18 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  35.38 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.32 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  36.1 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  33.2 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  32.95 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  36.62 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  29.44 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  31.33 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  30.92 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  30.92 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.52 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  30.8 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.69 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  27.63 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  29.53 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  29.25 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  31.37 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.05 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  30.98 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  30.98 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  27.05 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  30.39 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.39 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  30.39 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  29.7 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  27.11 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  28.09 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  28.26 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  27.01 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  44.44 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  25.6 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>