208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0757 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  95.18 
 
 		 249 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  89.16 
 
 		 249 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  75.9 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  75.1 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  79.52 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  77.91 
 
 		 249 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  75.5 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  75.5 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  75.5 
 
 		 249 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  75.9 
 
 		 249 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  78.54 
 
 		 234 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  54.33 
 
 		 252 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  53.36 
 
 		 252 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  52.12 
 
 		 274 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  53.69 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  53.69 
 
 		 261 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  51.22 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  41.63 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  41.67 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2094  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3404  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  37.6 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1348  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  38.66 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  40.6 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1013  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  35.78 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1942  tol-pal system protein YbgF  36 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.452944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  29.8 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  29.48 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  28.84 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  27.72 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  40.54 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  27.68 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  29.09 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.41 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  25.97 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.65 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.9 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  29.9 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  27.18 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.62 
 
 		 322 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  29.44 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.13 
 
 		 322 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  28.87 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  28.12 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  27.83 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  28.5 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  28.78 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  22.22 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  28.88 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  29.26 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  34.15 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  29.1 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  34.15 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  34.15 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  27.42 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.37 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.12 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  24.77 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.5 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.11 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  34.65 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  24.22 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  26.24 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  26.24 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  23.41 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.39 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  26.7 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  25.13 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  25.74 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  25.76 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  29.53 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26.11 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>