More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5449 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  60.79 
 
 
595 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  77.65 
 
 
669 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  68.89 
 
 
604 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  61.8 
 
 
599 aa  703    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  59.76 
 
 
581 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  80.98 
 
 
626 aa  932    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.15 
 
 
669 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  59.18 
 
 
599 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  79.3 
 
 
620 aa  944    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  79.3 
 
 
620 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.64 
 
 
663 aa  889    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  79.64 
 
 
620 aa  960    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.65 
 
 
669 aa  863    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.98 
 
 
669 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  66.94 
 
 
601 aa  818    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  61.86 
 
 
600 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  61.13 
 
 
595 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  78.12 
 
 
625 aa  948    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  77.51 
 
 
625 aa  934    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  65.72 
 
 
596 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  77.65 
 
 
669 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  62.29 
 
 
600 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  78.15 
 
 
669 aa  869    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  64.95 
 
 
572 aa  777    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  79.64 
 
 
620 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  60.21 
 
 
595 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  66.39 
 
 
596 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  100 
 
 
622 aa  1246    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  61.28 
 
 
605 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  79.3 
 
 
620 aa  943    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  77.65 
 
 
669 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.61 
 
 
603 aa  772    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  79.64 
 
 
620 aa  960    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  55.85 
 
 
630 aa  634  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  50.6 
 
 
598 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  50.86 
 
 
585 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.3 
 
 
596 aa  524  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  46.05 
 
 
593 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  40.58 
 
 
591 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  37.37 
 
 
567 aa  336  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  36.96 
 
 
597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.59 
 
 
595 aa  322  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  37.76 
 
 
603 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  36.05 
 
 
643 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.01 
 
 
651 aa  316  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.99 
 
 
621 aa  316  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.11 
 
 
623 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.11 
 
 
623 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.14 
 
 
589 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  34.05 
 
 
597 aa  313  7.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  35.95 
 
 
623 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.08 
 
 
623 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  36.17 
 
 
623 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  34.32 
 
 
609 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  35.63 
 
 
630 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  36.11 
 
 
606 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  38.21 
 
 
624 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  37.56 
 
 
599 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.26 
 
 
629 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  35.29 
 
 
591 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.99 
 
 
617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  38.28 
 
 
621 aa  307  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  33.62 
 
 
637 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.36 
 
 
624 aa  306  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  33.62 
 
 
637 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.45 
 
 
637 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  34.86 
 
 
590 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.95 
 
 
598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.15 
 
 
610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  35.95 
 
 
623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  33.05 
 
 
607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1622  ABC transporter related  35.75 
 
 
621 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  36.89 
 
 
637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  33.45 
 
 
637 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.29 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.29 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.29 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.29 
 
 
623 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.29 
 
 
623 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.29 
 
 
623 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  36.29 
 
 
654 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  35.78 
 
 
623 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  35.8 
 
 
622 aa  303  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  34.22 
 
 
622 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  33.62 
 
 
663 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 
592 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  35.78 
 
 
623 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  35.05 
 
 
612 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  33.62 
 
 
636 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  35.43 
 
 
626 aa  301  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  40.26 
 
 
610 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  37.5 
 
 
637 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  39.26 
 
 
627 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  34.71 
 
 
612 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>