More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3714 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  100 
 
 		 418 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  67.82 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  58.47 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  40.52 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 408 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  35.67 
 
 		 401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  37.91 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 735 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  38.17 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  32.98 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  32.98 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  32.98 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  32.71 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  32.71 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  32.96 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  32.09 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  34.57 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.85 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  35.96 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  31.51 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  32.11 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 398 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 416 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 401 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.65 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.65 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.39 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  32.64 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  31.35 
 
 		 407 aa  156  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  32.13 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.14 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  31.22 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  31.54 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  31.3 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  31.3 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  31.3 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  30.65 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  31.17 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  30.85 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.77 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>