More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2850 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 165 aa  326  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  93.94 
 
 		 165 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  93.94 
 
 		 165 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  93.94 
 
 		 165 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  93.33 
 
 		 165 aa  309  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  96.93 
 
 		 167 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  96.93 
 
 		 167 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  93.94 
 
 		 165 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  93.33 
 
 		 165 aa  279  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  93.33 
 
 		 165 aa  279  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  93.33 
 
 		 165 aa  279  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  93.33 
 
 		 165 aa  280  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  84.66 
 
 		 168 aa  279  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  92.73 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  92.73 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  92.73 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  92.73 
 
 		 184 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  91.52 
 
 		 188 aa  274  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  93.57 
 
 		 140 aa  265  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  80.12 
 
 		 168 aa  264  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  80.12 
 
 		 168 aa  264  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  79.38 
 
 		 173 aa  258  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  79.08 
 
 		 173 aa  250  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  72.12 
 
 		 165 aa  237  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  74.15 
 
 		 167 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  67.28 
 
 		 174 aa  213  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 174 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  69.28 
 
 		 179 aa  210  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  68.63 
 
 		 215 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 174 aa  197  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  62.35 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  66.25 
 
 		 182 aa  193  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  60.84 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  60.62 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  60.62 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  60 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  59.64 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  59.64 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  59.26 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  61.59 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  59.23 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  48.34 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  44.58 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  45.34 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  45.34 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  50.65 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.86 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  44.31 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  48.39 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  43.11 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  44.17 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 174 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  42.17 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  42.17 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  44.17 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  41.32 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  42.51 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  43.51 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  44.72 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>