60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2811 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
247 aa  478  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  40.61 
 
 
234 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 
242 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  37.76 
 
 
241 aa  141  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  37.04 
 
 
977 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  36.63 
 
 
244 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  36.86 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  35.8 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  34.17 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  34.58 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  34.58 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  36.82 
 
 
964 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 
244 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  32.64 
 
 
244 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  36.68 
 
 
972 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  32.19 
 
 
235 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  35.68 
 
 
244 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 
235 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  34.02 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  35.34 
 
 
998 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  30.54 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  33.74 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
256 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  32.27 
 
 
240 aa  111  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.76 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.86 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.16 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  27.21 
 
 
287 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 
234 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  31.65 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  30.83 
 
 
242 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  25.1 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.77 
 
 
748 aa  82.4  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  27.71 
 
 
891 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  25.77 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.83 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  28.52 
 
 
736 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  27.42 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  26.17 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
768 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  28.81 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28.46 
 
 
767 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
267 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  25 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  25.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  27.98 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  37.4 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1357  hypothetical protein  29.41 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.124612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.06 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  29.51 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  24.86 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>