More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0688 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  100 
 
 		 388 aa  801    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.92 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  57.66 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  56.88 
 
 		 402 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  56.66 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  57.44 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  56.05 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  57.18 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  53.65 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  54.19 
 
 		 389 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  55.12 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  53.4 
 
 		 407 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  55.24 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  56.4 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  53.93 
 
 		 389 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  53.39 
 
 		 391 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  54.31 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  53.65 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  53.02 
 
 		 400 aa  411  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  50.78 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  53.37 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  50.79 
 
 		 391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  52.48 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  52.07 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.35 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.09 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  48.59 
 
 		 402 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  48.7 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.53 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  48.29 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  47.94 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.65 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  46.92 
 
 		 398 aa  349  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.42 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  45.67 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.76 
 
 		 384 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  45.17 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.79 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  48.3 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.76 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  49.06 
 
 		 378 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  48.56 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.62 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.4 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.13 
 
 		 388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  46.21 
 
 		 410 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.01 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.31 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  45 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  45.19 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  45.6 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.91 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  43.75 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.38 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  44.87 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.95 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  44.91 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.3 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.05 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.31 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  44.91 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  46.65 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  43.51 
 
 		 395 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  46.15 
 
 		 380 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.49 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.77 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  44.13 
 
 		 404 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  41.21 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 401 aa  306  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  41.6 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 		 436 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 		 436 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  42.34 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  41.34 
 
 		 403 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.2 
 
 		 1143 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.68 
 
 		 383 aa  302  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  42.63 
 
 		 395 aa  301  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  42.09 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  43.65 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.26 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.34 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.99 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  43.98 
 
 		 396 aa  299  4e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 380 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  42.41 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>