More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5752 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  58.02 
 
 
352 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  58.26 
 
 
364 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  58.26 
 
 
343 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  57.43 
 
 
373 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  58.19 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
344 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.09 
 
 
321 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
342 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 
398 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  39.4 
 
 
350 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  33.33 
 
 
333 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  34.11 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
340 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
347 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
336 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
336 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
347 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
369 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
372 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
330 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
366 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 
382 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
366 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
366 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
345 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
345 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
345 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  27.79 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  32.42 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
356 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
364 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  31.34 
 
 
339 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  28.53 
 
 
345 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 
396 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  31.05 
 
 
339 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 
340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  29.67 
 
 
345 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  34.17 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 
344 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 
336 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 
341 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 
354 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
360 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  29.18 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
356 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
360 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 
335 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 
356 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.48 
 
 
343 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
247 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 
355 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 
346 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  31.54 
 
 
352 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.9 
 
 
335 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5855  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
385 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6097  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6017  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 
425 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.938285  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7549  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6580  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
364 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111702  normal  0.0245572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5733  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
389 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.874497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
356 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 
356 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.18 
 
 
335 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
360 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
346 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  29.97 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  30.32 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4268  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 
367 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6093  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0365291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>