More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2071 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2071  sun protein  100 
 
 		 463 aa  913    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  65.83 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  50.56 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  51.15 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  52.52 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  51.03 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  51.15 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  51.99 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  49.1 
 
 		 450 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  49.89 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.56 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  54.78 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.78 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  49.56 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  54.23 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.31 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  45.57 
 
 		 465 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  45.57 
 
 		 465 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.07 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  52.38 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  51.49 
 
 		 440 aa  355  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  42.7 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  44.93 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  45.98 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  44.59 
 
 		 493 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.01 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.47 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  45.45 
 
 		 438 aa  306  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.51 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.66 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  44.56 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  41.56 
 
 		 419 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  41.31 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.3 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.22 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  39.73 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.27 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  34.12 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  34.81 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  36.3 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.78 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  32.68 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  33.7 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  35.65 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.85 
 
 		 425 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.71 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.78 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.96 
 
 		 427 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.86 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  34.52 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  32.68 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  34.74 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  34.74 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  34.74 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  34.52 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  37.88 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  33.11 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  35.01 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.67 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  34.08 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  34.08 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  32.45 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  33.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  33.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  33.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.03 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  32.45 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.85 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  32.23 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  33.11 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  33.63 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  32 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  32 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  32 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  34.95 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  33.41 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.78 
 
 		 462 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  32.66 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  32.97 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  33.04 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  32.23 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  32.68 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  32.23 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  32.23 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  34.71 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  32.68 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  34.73 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  32.83 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.7 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  35.38 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.57 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  34.68 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  30.38 
 
 		 429 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  34.51 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.36 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  29.28 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.7 
 
 		 418 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  35.55 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>