131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 122 aa  238  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  56.88 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  49.59 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  45.61 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  50.56 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  45.61 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  44.55 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  44.55 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  44.55 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  48.15 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  47.71 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  57.35 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  51.72 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  42.24 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  54.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  41.12 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  40.74 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  41.74 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  40.65 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  47.78 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  45.35 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  40.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  52.24 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  47.52 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.69 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.89 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  33.66 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  41.49 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.68 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.67 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  35.11 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.38 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.38 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  41.84 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.41 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  51.49 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.69 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.38 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  38.1 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.94 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  47.76 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  38.89 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.83 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  29.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  50.57 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  37.5 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  40.28 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  39.32 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  32.73 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  31.58 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.04 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  46.51 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  38.2 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.62 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  47.37 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  49.18 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  29.63 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  29.63 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.78 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  28.44 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  57.38 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  44.3 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  39.06 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  71.43 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  27.97 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  41.24 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  75 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.06 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  27.52 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  43.66 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  43.66 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.02 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  45.07 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  46.3 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>