More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  100 
 
 
414 aa  832    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  65.53 
 
 
460 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  67.49 
 
 
411 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  65.48 
 
 
402 aa  530  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  65 
 
 
405 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  63.61 
 
 
410 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  60.1 
 
 
405 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  64.22 
 
 
413 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  64.39 
 
 
400 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  61.35 
 
 
406 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  63.25 
 
 
409 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  62.03 
 
 
401 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  63.04 
 
 
401 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  59.9 
 
 
411 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  63.89 
 
 
402 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  63.79 
 
 
415 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  61.35 
 
 
415 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  63.13 
 
 
402 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  61.52 
 
 
402 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  61.52 
 
 
415 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  61.63 
 
 
412 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  56.09 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  55.92 
 
 
412 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  47.34 
 
 
397 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  50.5 
 
 
398 aa  365  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 
395 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  358  9e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
395 aa  358  9e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  43 
 
 
397 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  44.22 
 
 
397 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
395 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 
395 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  46.56 
 
 
398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  46.53 
 
 
393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  44.02 
 
 
395 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  45.82 
 
 
396 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
396 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  45.38 
 
 
401 aa  345  7e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  46.02 
 
 
402 aa  345  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  39.29 
 
 
395 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  44.05 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.81 
 
 
394 aa  338  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  42.93 
 
 
397 aa  338  8e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.27 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 
399 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  38.52 
 
 
399 aa  332  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
400 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  43.69 
 
 
400 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  43.69 
 
 
400 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 
392 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  46.12 
 
 
404 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  43.99 
 
 
396 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  41.48 
 
 
397 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  41.65 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  41.06 
 
 
399 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  45.04 
 
 
390 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  41.79 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  42.68 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
398 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  42.42 
 
 
388 aa  325  9e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  43.94 
 
 
400 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 
407 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  44.02 
 
 
393 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  40.46 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  43 
 
 
397 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  42.28 
 
 
394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  42.39 
 
 
400 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  41.48 
 
 
397 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  40.36 
 
 
390 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 
395 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  42.42 
 
 
402 aa  315  8e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  43.26 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  42.89 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  41.43 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  42.01 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  44.64 
 
 
390 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  41.54 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  41.65 
 
 
401 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  40.52 
 
 
399 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  41.49 
 
 
402 aa  310  4e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  41.22 
 
 
392 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  40.51 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  42.42 
 
 
400 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 
400 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  40.62 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  40.4 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  39.69 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  41.77 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  41.56 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>