More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11140 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  777    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.33 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.01 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.45 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.5 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  58.92 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  58.2 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  58.11 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  58.92 
 
 		 359 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  57.1 
 
 		 363 aa  362  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  58.65 
 
 		 363 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.6 
 
 		 363 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  57.03 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.23 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  54.76 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.14 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.73 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.64 
 
 		 379 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  53.39 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  53.35 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  55.1 
 
 		 379 aa  334  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.5 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.76 
 
 		 618 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  59.22 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.68 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  55.11 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.22 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  53.17 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.12 
 
 		 330 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.12 
 
 		 330 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.82 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  48.86 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.36 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  52.53 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.99 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.63 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  38.72 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.89 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.16 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.77 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.83 
 
 		 361 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  33.59 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  30.83 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  30.83 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  30.83 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.49 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  31.03 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.5 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  32.3 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.79 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  32.28 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.69 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.43 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  30.51 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  30.86 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  31.79 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.12 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.2 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  30.77 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  30.85 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.78 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.34 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.69 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  31.23 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  30.49 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  31.69 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 		 403 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  30 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  31.19 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  33.06 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  30.43 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1027  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000262896  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.09 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  30.71 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  31.23 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  31.23 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  31.23 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  31.23 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  30.18 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  31.23 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  31.19 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1308  aspartate aminotransferase  28.35 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.698251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  28.89 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 404 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  30 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  30.85 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  31.23 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  29.63 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 		 425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  30.93 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  31.17 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  31.17 
 
 		 412 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>