More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1275 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1275  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  100 
 
 
709 aa  1440  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  38.76 
 
 
696 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.4 
 
 
710 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  38.47 
 
 
698 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0399  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 
695 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1926  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.33 
 
 
575 aa  407  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1911  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 
577 aa  400  1e-110  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1776  putative PAS/PAC sensor protein  39.72 
 
 
698 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2250  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.58 
 
 
571 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28606  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4639  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.9 
 
 
574 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  39.37 
 
 
935 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2756  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.01 
 
 
462 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2053  transcriptional regulator  40.04 
 
 
696 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  6.40776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1051  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.89 
 
 
688 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1164  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.17 
 
 
501 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.245431  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0294  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0311  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0355  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0298  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0400  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0351818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0326  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0358  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.42 
 
 
455 aa  364  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1492  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.47 
 
 
569 aa  363  7e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0304  putative PAS/PAC sensor protein  43.27 
 
 
459 aa  362  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0306  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.54 
 
 
455 aa  362  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  41.36 
 
 
877 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2667  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  38.31 
 
 
668 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2353  phosphocarrier HPr/sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  38.14 
 
 
668 aa  356  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2683  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.44 
 
 
566 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2214  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.79 
 
 
592 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.345711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1805  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.04 
 
 
483 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2412  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.62 
 
 
484 aa  344  3e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3934  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.26 
 
 
501 aa  344  3e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534742  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0372  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.88 
 
 
455 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4948  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.88 
 
 
455 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0118  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.03 
 
 
591 aa  341  3e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4873  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40.6 
 
 
483 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5150  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.06 
 
 
549 aa  338  2e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2835  putative PAS/PAC sensor protein  39.91 
 
 
591 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.81177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1999  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.26 
 
 
573 aa  333  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5183  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.39 
 
 
474 aa  328  2e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0160974  normal  0.0962758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1434  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.53 
 
 
466 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0533  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.39 
 
 
474 aa  326  8e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0137425  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1270  Fis family transcriptional regulator  36.56 
 
 
464 aa  319  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.912527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0762  putative PAS/PAC sensor protein  37.53 
 
 
457 aa  315  3e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0489  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.7 
 
 
473 aa  313  7e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2082  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.89 
 
 
535 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06720  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.3 
 
 
581 aa  310  7e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0365  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.12 
 
 
464 aa  308  2e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1889  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.87 
 
 
752 aa  308  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1585  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.78 
 
 
462 aa  307  5e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.613475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2688  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.48 
 
 
597 aa  305  2e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0174  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.26 
 
 
451 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0219  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.75 
 
 
605 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.355755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1725  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.83 
 
 
575 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0604  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.75 
 
 
476 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4187  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.5 
 
 
690 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32878e-11 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0303  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.76 
 
 
576 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.535404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3910  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.5 
 
 
690 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3919  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.5 
 
 
690 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.346796  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0155  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.52 
 
 
574 aa  295  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4072  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.5 
 
 
690 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4389  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.5 
 
 
690 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0808  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.62 
 
 
591 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0663  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 
527 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2143  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.64 
 
 
463 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.28 
 
 
690 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0090  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.49 
 
 
541 aa  289  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00173924  hitchhiker  0.00306857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.38 
 
 
688 aa  289  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0260  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.9 
 
 
687 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4239  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.17 
 
 
690 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.55 
 
 
690 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4277  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.17 
 
 
704 aa  288  3e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0018  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.62 
 
 
562 aa  288  3e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.32366e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  33.8 
 
 
600 aa  287  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.58727e-05  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.52 
 
 
463 aa  286  6e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4297  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.01 
 
 
690 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2866  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.31 
 
 
703 aa  286  1e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0957  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.11 
 
 
690 aa  285  2e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0027  sigma-54 factor, interaction region  38.15 
 
 
477 aa  285  2e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.640568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1494  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.44 
 
 
470 aa  283  7e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2887  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
553 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2741  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.2 
 
 
471 aa  282  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2865  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
553 aa  282  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0882219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4849  NifA subfamily transcriptional regulator  50.4 
 
 
566 aa  281  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.728864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1719  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.25 
 
 
582 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1746  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
563 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2445  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.9 
 
 
553 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.210628  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2561  sigma-54-dependent transcriptional activator  40.9 
 
 
553 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2848  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.9 
 
 
553 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0615513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  49.03 
 
 
461 aa  277  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2836  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.63 
 
 
553 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2842  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.63 
 
 
553 aa  276  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000148111 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2645  sensory box sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  40.63 
 
 
553 aa  276  7e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  48.37 
 
 
461 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.96 
 
 
468 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2837  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 
476 aa  276  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  49.03 
 
 
461 aa  276  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  49.03 
 
 
461 aa  276  1e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  49.03 
 
 
461 aa  276  1e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>