More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3804 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  100 
 
 
335 aa  679    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  85.67 
 
 
335 aa  587  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  85.67 
 
 
335 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  85.37 
 
 
335 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  85.67 
 
 
335 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  85.07 
 
 
335 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  85.07 
 
 
335 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  84.78 
 
 
335 aa  559  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  84.78 
 
 
335 aa  551  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5135  ABC transporter ATP-binding protein, N-terminus  82.25 
 
 
169 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  89.17 
 
 
137 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3599  response regulator receiver protein  29.55 
 
 
373 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.485961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2673  ABC transporter related protein  31.33 
 
 
330 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  30.69 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
255 aa  92.8  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  25.4 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.09 
 
 
251 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.94 
 
 
265 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.66 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.5 
 
 
253 aa  89.7  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  28.04 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  28.35 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  29.63 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  28.02 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.09 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  28.85 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  28.32 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  28.36 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.98 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  27.24 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  26.1 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  28.24 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  27.27 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  28.35 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  26.38 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  26.67 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  29.17 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  27.6 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  30 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  30 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  25.74 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  27.08 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  27.82 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  30.99 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  30 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2304  ABC transporter, ATPase subunit  29.38 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.666895  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  24.37 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  26.96 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  29.05 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  28.49 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  26.46 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.98 
 
 
237 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0840  ABC transporter related  28.7 
 
 
231 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  28.11 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  26.32 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  28.08 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  28 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.12 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  26.4 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  25.93 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  28.65 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  22.07 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  29 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  25.76 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  24.82 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  27.13 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.49 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  26.91 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.07 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  28.04 
 
 
286 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  29.79 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  23.35 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  25.28 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  28.49 
 
 
290 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  25 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  24.61 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.06 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  27.14 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.12 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  25.1 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  26.26 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  27.31 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  25.63 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  28 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  27.57 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  26.34 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  26.26 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  24.64 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  25.24 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  24.17 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  24.64 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  26.26 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>