More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2171 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  78.21 
 
 
513 aa  809  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  84.2 
 
 
506 aa  849  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  63.18 
 
 
502 aa  639  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  62.98 
 
 
502 aa  637  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  62.58 
 
 
503 aa  634  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  95.46 
 
 
507 aa  952  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
507 aa  1022  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  96.45 
 
 
507 aa  961  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  77.56 
 
 
521 aa  791  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  61.32 
 
 
520 aa  642  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  64 
 
 
501 aa  663  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  95.27 
 
 
507 aa  953  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  84.23 
 
 
506 aa  856  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  84.2 
 
 
506 aa  849  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  62.78 
 
 
502 aa  637  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  84.89 
 
 
509 aa  867  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  78.1 
 
 
515 aa  819  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  63.6 
 
 
501 aa  657  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  84.6 
 
 
506 aa  852  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  96.45 
 
 
507 aa  961  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  84.6 
 
 
506 aa  860  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  84.6 
 
 
506 aa  860  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  62.78 
 
 
502 aa  637  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  92.56 
 
 
511 aa  939  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  62.78 
 
 
502 aa  637  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  63.31 
 
 
503 aa  642  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  96.45 
 
 
507 aa  961  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  59.52 
 
 
523 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  60.12 
 
 
561 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
564 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
546 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
564 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  61.18 
 
 
562 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  60.12 
 
 
564 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  60.12 
 
 
564 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  54.21 
 
 
569 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  58.63 
 
 
509 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  55.91 
 
 
504 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  55.84 
 
 
507 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.88 
 
 
501 aa  460  1e-128  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  48.47 
 
 
499 aa  458  1e-128  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  49.29 
 
 
488 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.9 
 
 
497 aa  452  1e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
501 aa  453  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  46.72 
 
 
501 aa  454  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  46.52 
 
 
501 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.11 
 
 
497 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.51 
 
 
495 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  50 
 
 
502 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.97 
 
 
503 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.32 
 
 
494 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 
492 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
495 aa  406  1e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  44.6 
 
 
490 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 
496 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
492 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 
501 aa  357  2e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.77 
 
 
489 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
488 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  39.48 
 
 
488 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
488 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
490 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
488 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  40.31 
 
 
495 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
511 aa  329  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  42.06 
 
 
506 aa  327  2e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  41.84 
 
 
502 aa  327  2e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
502 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
502 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
498 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
502 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
492 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  41.16 
 
 
488 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.4 
 
 
494 aa  322  9e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.06 
 
 
491 aa  322  1e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
507 aa  322  1e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  39.92 
 
 
492 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  41.6 
 
 
502 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.62 
 
 
507 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
470 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  41.68 
 
 
502 aa  316  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.74 
 
 
471 aa  312  7e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
485 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.19 
 
 
499 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  39.09 
 
 
498 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
492 aa  310  3e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  38.36 
 
 
485 aa  309  6e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.94 
 
 
472 aa  309  1e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
475 aa  307  2e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.29 
 
 
523 aa  308  2e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 
485 aa  308  2e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
490 aa  307  2e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
487 aa  306  5e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
516 aa  306  5e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
492 aa  306  8e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
486 aa  305  9e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.82 
 
 
499 aa  304  2e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.57 
 
 
500 aa  305  2e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
470 aa  305  2e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.93 
 
 
495 aa  304  2e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>