More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0867 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
329 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  83.28 
 
 
329 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  60.25 
 
 
330 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  60.25 
 
 
330 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  59.31 
 
 
330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  56.29 
 
 
328 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 
324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  54.4 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 
327 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  53.31 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 
329 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 
332 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  53.73 
 
 
327 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  53.11 
 
 
327 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.62 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.24 
 
 
332 aa  335  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  52.98 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 
324 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
332 aa  334  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
328 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
328 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 
324 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 
323 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.25 
 
 
331 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 
337 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  51.09 
 
 
327 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.42 
 
 
327 aa  316  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.23 
 
 
321 aa  316  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
328 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  49.07 
 
 
333 aa  315  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 
337 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  51.89 
 
 
320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.97 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  49.53 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
332 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  52.04 
 
 
330 aa  309  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  53.77 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
324 aa  306  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  53.77 
 
 
321 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 
328 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  49.05 
 
 
354 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  51.85 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  47.48 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.28 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 
324 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
349 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 
324 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 
329 aa  299  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 
330 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 
332 aa  298  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 
350 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.26 
 
 
331 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 
331 aa  295  6e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 
326 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.57 
 
 
327 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  45.51 
 
 
348 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.17 
 
 
326 aa  291  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.8 
 
 
330 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  47.5 
 
 
331 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  43.44 
 
 
325 aa  288  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 
322 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.27 
 
 
330 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
330 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 
332 aa  286  4e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 
328 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 
330 aa  285  5.999999999999999e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.72 
 
 
356 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 
328 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  46.73 
 
 
334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 
329 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
328 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  42.32 
 
 
329 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
328 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.12 
 
 
329 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 
353 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.82 
 
 
328 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  49.15 
 
 
318 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
328 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 
328 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 
330 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 
338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.06 
 
 
337 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 
337 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 
328 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 
327 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 
337 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>