69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4164 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  916    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  64.38 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  63.73 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  31.23 
 
 		 1276 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.12 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.21 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  28.94 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  29.03 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.39 
 
 		 604 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  30.95 
 
 		 564 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  29.85 
 
 		 562 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  28.7 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 437 aa  91.3  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  30.09 
 
 		 803 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  30.79 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  29.73 
 
 		 340 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.84 
 
 		 891 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1086 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  28.35 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  26.07 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.92 
 
 		 801 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  26.22 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  26.74 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  22.4 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.42 
 
 		 873 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  25.37 
 
 		 1141 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.57 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  26.24 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  27.93 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.47 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  28.91 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.86 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.33 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  25.69 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  25.44 
 
 		 601 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.78 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  23.93 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  20.72 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  25.59 
 
 		 601 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.53 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  23.58 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  28.64 
 
 		 369 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.14 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  29.22 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.32 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.5 
 
 		 584 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  26.2 
 
 		 550 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  27.44 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  30.88 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  27.37 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  22.78 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  22.32 
 
 		 597 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  27.4 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  22.34 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  27.5 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  21.43 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  26.2 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  24.66 
 
 		 333 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  26.37 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>