More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4361 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  70.85 
 
 		 743 aa  1040    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  62.71 
 
 		 841 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  76.56 
 
 		 844 aa  1129    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  76.53 
 
 		 839 aa  1122    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.77 
 
 		 743 aa  1038    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  63.19 
 
 		 846 aa  917    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  70.12 
 
 		 698 aa  986    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  70.83 
 
 		 850 aa  1033    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  65.45 
 
 		 821 aa  1096    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  76.68 
 
 		 928 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.77 
 
 		 846 aa  915    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  76.69 
 
 		 844 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  69.2 
 
 		 742 aa  1034    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  94.25 
 
 		 862 aa  1537    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  98.61 
 
 		 858 aa  1551    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  76.53 
 
 		 839 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  70.57 
 
 		 787 aa  1033    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  79.67 
 
 		 787 aa  1102    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  76.56 
 
 		 844 aa  1129    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  58.84 
 
 		 678 aa  776    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  63.8 
 
 		 810 aa  905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  88.51 
 
 		 888 aa  1357    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  76.56 
 
 		 844 aa  1129    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  57.12 
 
 		 675 aa  794    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  62.73 
 
 		 801 aa  901    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  74 
 
 		 838 aa  1126    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 		 686 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  70.82 
 
 		 826 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  71.74 
 
 		 732 aa  1011    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  70.77 
 
 		 743 aa  1038    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 857 aa  1741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  66.62 
 
 		 846 aa  900    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  90.75 
 
 		 857 aa  1427    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  75.28 
 
 		 834 aa  1107    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  91.56 
 
 		 870 aa  1431    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  71.62 
 
 		 728 aa  1008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 857 aa  1741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  51.4 
 
 		 783 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.88 
 
 		 743 aa  474  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.69 
 
 		 850 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.72 
 
 		 750 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.84 
 
 		 730 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.88 
 
 		 762 aa  439  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.56 
 
 		 755 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 774 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.61 
 
 		 760 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.97 
 
 		 752 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.34 
 
 		 854 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.64 
 
 		 815 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  36.6 
 
 		 740 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.6 
 
 		 786 aa  415  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.98 
 
 		 762 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.81 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 768 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.41 
 
 		 759 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35 
 
 		 786 aa  392  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.16 
 
 		 772 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.28 
 
 		 767 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.39 
 
 		 907 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.01 
 
 		 765 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.16 
 
 		 785 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.26 
 
 		 776 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.53 
 
 		 773 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.69 
 
 		 661 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  31.79 
 
 		 771 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 766 aa  304  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  31.23 
 
 		 827 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  30.25 
 
 		 823 aa  302  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  30.39 
 
 		 823 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.52 
 
 		 748 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 646 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  31.06 
 
 		 839 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  30.92 
 
 		 839 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  30.92 
 
 		 839 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.47 
 
 		 648 aa  295  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 681 aa  294  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.2 
 
 		 712 aa  294  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.75 
 
 		 679 aa  294  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.7 
 
 		 810 aa  293  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.75 
 
 		 795 aa  293  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  31.42 
 
 		 790 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.17 
 
 		 625 aa  291  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 683 aa  290  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 790 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  32.92 
 
 		 707 aa  289  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  29.8 
 
 		 819 aa  288  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.95 
 
 		 761 aa  288  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  32.23 
 
 		 833 aa  287  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.1 
 
 		 648 aa  287  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  30.08 
 
 		 804 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  31.79 
 
 		 807 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 713 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 713 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 713 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  32.79 
 
 		 850 aa  283  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  32.79 
 
 		 850 aa  283  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  32.79 
 
 		 850 aa  283  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 850 aa  282  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  32.79 
 
 		 850 aa  282  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.13 
 
 		 709 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>