More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2583 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  99.44 
 
 		 535 aa  1048    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  73.58 
 
 		 529 aa  749    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  90.11 
 
 		 536 aa  937    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  784    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  94.77 
 
 		 535 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  81.48 
 
 		 539 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  73.6 
 
 		 537 aa  779    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  81.75 
 
 		 539 aa  825    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  71.35 
 
 		 529 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  94.02 
 
 		 535 aa  935    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  94.21 
 
 		 535 aa  949    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  81.68 
 
 		 539 aa  784    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  69.79 
 
 		 548 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  100 
 
 		 535 aa  1052    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  57.42 
 
 		 518 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  55.09 
 
 		 533 aa  554  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.67 
 
 		 551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  52.22 
 
 		 540 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  52.23 
 
 		 542 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  51.5 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  52.25 
 
 		 540 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.17 
 
 		 499 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.68 
 
 		 540 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  47.57 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.78 
 
 		 536 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  47.34 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  46.82 
 
 		 527 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  46.96 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  46.02 
 
 		 525 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  44.07 
 
 		 529 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.49 
 
 		 533 aa  398  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  46.36 
 
 		 542 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  46.32 
 
 		 528 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  36.79 
 
 		 535 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  39.76 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.15 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.25 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.25 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.04 
 
 		 562 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  35.33 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.58 
 
 		 658 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.67 
 
 		 559 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.48 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.67 
 
 		 542 aa  200  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.39 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.6 
 
 		 589 aa  190  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.08 
 
 		 572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.62 
 
 		 503 aa  183  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.95 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.64 
 
 		 551 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.56 
 
 		 563 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.43 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  27.97 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  26.9 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.56 
 
 		 554 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.5 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 489 aa  159  9e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.31 
 
 		 567 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.18 
 
 		 573 aa  158  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.78 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.61 
 
 		 556 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.59 
 
 		 561 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 584 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.34 
 
 		 586 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.71 
 
 		 584 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.084297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  27.26 
 
 		 574 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  27.26 
 
 		 574 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.37 
 
 		 574 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.18 
 
 		 618 aa  153  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.02 
 
 		 553 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 		 604 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 		 574 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.26 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  26.33 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  28.41 
 
 		 553 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  29.57 
 
 		 551 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.65 
 
 		 593 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.79 
 
 		 569 aa  151  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.62 
 
 		 572 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.17 
 
 		 557 aa  150  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 549 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.28 
 
 		 564 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.39 
 
 		 572 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  25.54 
 
 		 578 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  26.68 
 
 		 566 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.03 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  30.13 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.7 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.83 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>