More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3744 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 484 aa  910    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  59.17 
 
 		 489 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  59.05 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  56.46 
 
 		 478 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 500 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 507 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.79 
 
 		 763 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 485 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 487 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 498 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.03 
 
 		 527 aa  220  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.14 
 
 		 498 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.99 
 
 		 553 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 		 508 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 482 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.37 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 		 534 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.16 
 
 		 474 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 		 482 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.96 
 
 		 482 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  46.77 
 
 		 303 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.72 
 
 		 490 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  33.78 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  34.74 
 
 		 497 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.03 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 507 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 491 aa  177  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 483 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 519 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 466 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  37.72 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.58 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 478 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  40.47 
 
 		 505 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  35.46 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 788 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.17 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.93 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.88 
 
 		 497 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  37 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  35.38 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.12 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.69 
 
 		 463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  33.72 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  37.44 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 480 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 501 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 500 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 506 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 518 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  32.75 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 		 1112 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 501 aa  156  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  28.99 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 482 aa  156  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  34.63 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.91 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 502 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>