136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0350 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  67.27 
 
 
110 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  98.08 
 
 
52 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  69.09 
 
 
68 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  68.63 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  67.31 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  67.31 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  68.63 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  57.63 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  57.63 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  57.63 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  68.75 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  53.12 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  57.69 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  60 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.69 
 
 
251 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  54.9 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  60.78 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  56 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  54.39 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  57.14 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  55.1 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.85 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  50.85 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  52.73 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  48.84 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  50.91 
 
 
70 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  57.45 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.86 
 
 
57 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.33 
 
 
221 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  52.08 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  48.98 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  43.18 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  44.19 
 
 
57 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  43.42 
 
 
88 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  44.16 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  40.32 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  57.45 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  41.18 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  44.64 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  40.68 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  39.47 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  49.12 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  45.28 
 
 
303 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  51.16 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  46.51 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  51.16 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  57.45 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  38.89 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  47.06 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  44.23 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  43.14 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  51.16 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  48.78 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  43.1 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  43.14 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  38.78 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  47.17 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  44.23 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  44.44 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  48 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  48 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  46 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  44 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  48.84 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  48.84 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  46 
 
 
102 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  48.84 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  40.74 
 
 
285 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  40.43 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  45.83 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  48 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  48 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  48 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  48.84 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  48.84 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  46 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  52.17 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  43.4 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  46.94 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  46.51 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  39.22 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  48.84 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  48.84 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  48.84 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  46 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  34.33 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  46.51 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  46.51 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  42.55 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>