More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2165 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  99.71 
 
 
343 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  90.64 
 
 
342 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  76.02 
 
 
342 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  74.34 
 
 
343 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  74.56 
 
 
342 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  74.56 
 
 
342 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  74.05 
 
 
343 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  74.56 
 
 
342 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  73.68 
 
 
342 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 
342 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
648 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
639 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
659 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
630 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.62 
 
 
630 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
604 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
604 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
604 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
604 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
63 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
253 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
253 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  30.05 
 
 
251 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 
253 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
253 aa  89.4  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  29.58 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
254 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
254 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  29.11 
 
 
253 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  31.11 
 
 
315 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
251 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  30.56 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  40.19 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  40.78 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  29.21 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  27.38 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  36.51 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  49.25 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
256 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  37.98 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  40.74 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.7 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  34.46 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.66 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.56 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.27 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  28.5 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  25.84 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  35.25 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  30.41 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  43.93 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  36.79 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  28.4 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  24.1 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  34.02 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  34.02 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.33 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  30.84 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
154 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>