68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0040 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  68.22 
 
 
319 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  46.11 
 
 
538 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  43.61 
 
 
544 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.75 
 
 
538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  42.41 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  42.55 
 
 
546 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  43.83 
 
 
539 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.3 
 
 
539 aa  215  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  40.19 
 
 
336 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.13 
 
 
533 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  40.06 
 
 
534 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  39.88 
 
 
336 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.63 
 
 
534 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  42.06 
 
 
336 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  41.74 
 
 
341 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  41.61 
 
 
342 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  38.82 
 
 
534 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.92 
 
 
533 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  39.94 
 
 
534 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.44 
 
 
533 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  39.82 
 
 
334 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  39.82 
 
 
334 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.42 
 
 
337 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  38.58 
 
 
336 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  37.16 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  36.75 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37.09 
 
 
575 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  35.87 
 
 
329 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.42 
 
 
330 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  36.36 
 
 
332 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  32.66 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.79 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  27.02 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  27.61 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  27.55 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  29.38 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  27.24 
 
 
339 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  26.61 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  25.78 
 
 
340 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  28.62 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  27.71 
 
 
330 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  27.56 
 
 
335 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  23.38 
 
 
345 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  27.1 
 
 
340 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  24.57 
 
 
324 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.54 
 
 
341 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  28.01 
 
 
557 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  27.16 
 
 
340 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  31.1 
 
 
543 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.23 
 
 
337 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  23.99 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  25.55 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  27.76 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  27.59 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  24.92 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  24.32 
 
 
540 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.91 
 
 
543 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  26 
 
 
544 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.89 
 
 
547 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  27.04 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  24.36 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.24 
 
 
559 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  24.24 
 
 
551 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1124  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.1 
 
 
668 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.352674  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1699  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  25.36 
 
 
616 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0347  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.33 
 
 
616 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>