90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0004 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0004  helicase conserved C- domain protein  100 
 
 
1116 aa  2308    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251802  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0012  hypothetical protein  38.58 
 
 
1098 aa  715    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0013  hypothetical protein  38.01 
 
 
861 aa  572  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0012  hypothetical protein  44.15 
 
 
562 aa  373  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0123  hypothetical protein  35.2 
 
 
597 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0015  hypothetical protein  35.56 
 
 
559 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.423513 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0124  hypothetical protein  41.19 
 
 
502 aa  322  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0457  DEAD-like helicase  28.33 
 
 
759 aa  233  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.888566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0972  DEAD-like helicase  28.38 
 
 
756 aa  231  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2220  helicase domain-containing protein  28.75 
 
 
756 aa  230  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2368  plasmid-related protein  29 
 
 
757 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1646  DEAD-like helicase  27.97 
 
 
759 aa  227  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.509694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1285  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 
759 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2330  helicase-like protein  27.85 
 
 
759 aa  222  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  unclonable  0.000000304607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0667  DEAD-like helicase  27.81 
 
 
760 aa  222  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0881388  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3405  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
759 aa  221  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.342787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0540  DEAD-like helicase  27.04 
 
 
757 aa  221  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4493  DEAD/DEAH box helicase  27.23 
 
 
749 aa  220  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1417  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
759 aa  218  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59540  hypothetical protein  27.27 
 
 
749 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0020175  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1463  DEAD/DEAH box helicase  26.35 
 
 
752 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2839  DEAD-like helicase  27.76 
 
 
756 aa  214  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1202  putative, plasmid-related, DNA/RNA helicase  27.12 
 
 
768 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4161  helicase domain-containing protein  29 
 
 
600 aa  176  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.17704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2701  helicase domain-containing protein  24.69 
 
 
788 aa  167  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_4999  hypothetical protein  24.94 
 
 
802 aa  146  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.664639  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0010  hypothetical protein  41.11 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3723  type III restriction enzyme, res subunit  22.7 
 
 
1113 aa  105  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0268  type III restriction protein res subunit  25 
 
 
1117 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.885001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2164  hypothetical protein  24.67 
 
 
1118 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.736314  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0254  hypothetical protein  33.85 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106224  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  22.99 
 
 
589 aa  56.2  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  29.92 
 
 
1080 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  21.95 
 
 
1072 aa  54.7  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  38.89 
 
 
638 aa  51.6  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.84 
 
 
914 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  26.17 
 
 
958 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 
1082 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.27 
 
 
918 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 
1120 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  26.11 
 
 
872 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  26.11 
 
 
876 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  23.95 
 
 
1134 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  27.34 
 
 
1086 aa  49.7  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
1108 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  25.49 
 
 
1178 aa  49.3  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  29.41 
 
 
1107 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  25.89 
 
 
1121 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.1 
 
 
666 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
1105 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  26.97 
 
 
1531 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  25.64 
 
 
1080 aa  48.5  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.84 
 
 
918 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.84 
 
 
918 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
1105 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
1152 aa  47.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  31.82 
 
 
1558 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.33 
 
 
1082 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
1765 aa  47.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  27.54 
 
 
985 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  27.61 
 
 
918 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26634  predicted protein  33.8 
 
 
233 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  28.95 
 
 
939 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  27.61 
 
 
918 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  29.29 
 
 
1078 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  28.46 
 
 
896 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  29.09 
 
 
1019 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.77 
 
 
1227 aa  47  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  23 
 
 
1148 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
1118 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  28.43 
 
 
1904 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.26 
 
 
918 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 
1246 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
1074 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  26.62 
 
 
1194 aa  46.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  26.88 
 
 
906 aa  45.8  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  31.37 
 
 
1019 aa  46.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.26 
 
 
918 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.26 
 
 
918 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.26 
 
 
918 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  26.36 
 
 
672 aa  45.8  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  24.16 
 
 
663 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.26 
 
 
918 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  37.93 
 
 
1075 aa  45.8  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  24.83 
 
 
971 aa  45.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  24.85 
 
 
1086 aa  45.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  26.09 
 
 
1100 aa  45.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
1050 aa  45.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  24.16 
 
 
1154 aa  44.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  22.39 
 
 
868 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>