More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1357 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  100 
 
 
351 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  74.64 
 
 
345 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4542  ferrochelatase  77.3 
 
 
345 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0861  ferrochelatase  76.99 
 
 
345 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  73.98 
 
 
347 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  75.77 
 
 
345 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  71.78 
 
 
370 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  61.21 
 
 
350 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  61.14 
 
 
345 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  61.36 
 
 
344 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  59.44 
 
 
353 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  58.4 
 
 
350 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0071  ferrochelatase  58.91 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0076  ferrochelatase  58.91 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  58.02 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  59.04 
 
 
344 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  58.02 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  58.02 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  58.11 
 
 
360 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2724  ferrochelatase  56.48 
 
 
353 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  56.63 
 
 
360 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  56.34 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  55.33 
 
 
353 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  51.97 
 
 
348 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0293  ferrochelatase  51.8 
 
 
370 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.523161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  51.37 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  49.71 
 
 
354 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  49.1 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2583  ferrochelatase  48.21 
 
 
343 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  49.37 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  49.39 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2635  ferrochelatase  47.67 
 
 
377 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.313718  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  52.15 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2858  ferrochelatase  47.31 
 
 
377 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1197  ferrochelatase  47.31 
 
 
377 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  51.06 
 
 
336 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  47.02 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  47.29 
 
 
370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  49.24 
 
 
367 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  49.55 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  48.78 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  48.77 
 
 
348 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  47.6 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  48.77 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  47.55 
 
 
363 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  48.77 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  48.77 
 
 
348 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  45.2 
 
 
354 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2583  ferrochelatase  46.46 
 
 
339 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  46.97 
 
 
370 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  47.6 
 
 
337 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  47.71 
 
 
371 aa  297  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  47.34 
 
 
364 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  47.24 
 
 
365 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.62 
 
 
327 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  47.37 
 
 
327 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  47.37 
 
 
327 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  47.85 
 
 
335 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  46.89 
 
 
320 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  49.4 
 
 
354 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  46.48 
 
 
373 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  47.06 
 
 
327 aa  292  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2660  ferrochelatase  45.67 
 
 
339 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0278413  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1801  ferrochelatase  46.15 
 
 
339 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.452842  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  45.67 
 
 
378 aa  292  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  46.08 
 
 
371 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  47.81 
 
 
355 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  47.06 
 
 
327 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2545  ferrochelatase  46.15 
 
 
339 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  46.02 
 
 
356 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  46.44 
 
 
337 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  45.51 
 
 
369 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  44.68 
 
 
368 aa  289  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  44.32 
 
 
356 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  44.41 
 
 
359 aa  288  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  45.78 
 
 
371 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  44.38 
 
 
367 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  44.6 
 
 
356 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  45.1 
 
 
367 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  44.92 
 
 
331 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  44.18 
 
 
344 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  45.18 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  43.36 
 
 
354 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0508  ferrochelatase  46.23 
 
 
324 aa  285  8e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1701  ferrochelatase  45.62 
 
 
335 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.491858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  44.58 
 
 
371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  45.62 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  45 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  44.48 
 
 
343 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  45.62 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  45.62 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  48.01 
 
 
370 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  45.62 
 
 
337 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  44.41 
 
 
321 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  45.62 
 
 
337 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  44.28 
 
 
371 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3034  ferrochelatase  47.47 
 
 
320 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  42.2 
 
 
360 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  48.22 
 
 
337 aa  280  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>