More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  100 
 
 
252 aa  503  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  76.19 
 
 
251 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0363  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  69.26 
 
 
256 aa  337  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0458  short chain dehydrogenase  68.87 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  57.31 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 
254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
255 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  52.59 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  52.59 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  52.59 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.17 
 
 
254 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
249 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 
256 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 
256 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 
256 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 
256 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  49.4 
 
 
257 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  49 
 
 
257 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  48.19 
 
 
257 aa  221  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
255 aa  208  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
235 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
267 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
247 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
255 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
257 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4196  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4719  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
252 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
260 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281486  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3035  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.53 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
249 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3349  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.75 
 
 
253 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0505  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
260 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
255 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3295  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.31 
 
 
253 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
255 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
256 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3248  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.75 
 
 
253 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371746 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3168  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.75 
 
 
253 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3788  short chain dehydrogenase  44.75 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
257 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.15 
 
 
253 aa  168  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.15 
 
 
253 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.15 
 
 
253 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
250 aa  168  8e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3552  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5468  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.107727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
259 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4815  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
241 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.2 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2990  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.55 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.916776  normal  0.048185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
257 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
263 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0848  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.14 
 
 
253 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.87 
 
 
247 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3185  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 
253 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358502  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0873  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.14 
 
 
253 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
269 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2989  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.14 
 
 
253 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0709919  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.76 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3233  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.35 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
263 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.53 
 
 
247 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.54 
 
 
261 aa  164  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3164  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.14 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4111  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.14 
 
 
253 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000566262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.8 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  41.18 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.55 
 
 
253 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2430  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
248 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  36.72 
 
 
260 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
270 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.11 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
260 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
257 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
245 aa  162  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0778  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.25 
 
 
249 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>