More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9249 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 300 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.42 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.37 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.7 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.7 
 
 		 271 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.25 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.94 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.69 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.1 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.79 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.84 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.05 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.07 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.17 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.66 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.77 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.77 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.74 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.77 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.29 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 		 272 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.23 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.74 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.92 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.44 
 
 		 272 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  37.78 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.68 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.23 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.41 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.96 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.77 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.77 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.33 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.51 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.03 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.5 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  44 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  36.9 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.72 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.86 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.32 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.01 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.01 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.01 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>