More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0782 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  544  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  544  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  84.13 
 
 
280 aa  460  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.37 
 
 
269 aa  318  6e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.69 
 
 
273 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.7 
 
 
300 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.16 
 
 
274 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.88 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.33 
 
 
281 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.01 
 
 
275 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.56 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.33 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 
273 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
269 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.84 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.06 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 
273 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.74 
 
 
285 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.96 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
301 aa  189  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
273 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.26 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.31 
 
 
267 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.96 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.28 
 
 
255 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
277 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
274 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
276 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.95 
 
 
273 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.01 
 
 
275 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.88 
 
 
273 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
272 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
271 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.86 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.97 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.58 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.91 
 
 
277 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  38.99 
 
 
283 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
279 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
273 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
275 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
273 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.89 
 
 
280 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
273 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.53 
 
 
273 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 
273 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.85 
 
 
272 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.77 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
270 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 
270 aa  166  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.67 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
272 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.69 
 
 
271 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
266 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
280 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
272 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
273 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
282 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0439  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.55 
 
 
275 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 
264 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0262  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.55 
 
 
275 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
271 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
272 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.17 
 
 
286 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 
272 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
270 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.29 
 
 
276 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 
274 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.05 
 
 
276 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.37 
 
 
270 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 
274 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
271 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.24 
 
 
264 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.46 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
272 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  42.98 
 
 
264 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
289 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.33 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
274 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.07 
 
 
269 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.3 
 
 
284 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
293 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
279 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
273 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 
270 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 
279 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
272 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>