More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3168 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 273 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.7 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.28 
 
 		 275 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.78 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.72 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.55 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.14 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.96 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.39 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.18 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.41 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.39 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.9 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.57 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.83 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.45 
 
 		 277 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.7 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.48 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.18 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.41 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.94 
 
 		 280 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  52 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.78 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.73 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.3 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.4 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.35 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.15 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  41.7 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.76 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.18 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.66 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.66 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.37 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.48 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.67 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.27 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.31 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.64 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  42.93 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.95 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.68 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>