More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3018 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  92 
 
 		 275 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  76.6 
 
 		 274 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  73.78 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.3 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.41 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.01 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.06 
 
 		 266 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.81 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.71 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.52 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.79 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.94 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.79 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.26 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.68 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.88 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.88 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.69 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.5 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.62 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.54 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.39 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.2 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.73 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.81 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.64 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.66 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.81 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.71 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.27 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  42.59 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.16 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.34 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.53 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.36 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.75 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  42.13 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.2 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.37 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.64 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>