More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0151 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.7 
 
 
280 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.37 
 
 
271 aa  318  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.37 
 
 
271 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.01 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.37 
 
 
300 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.21 
 
 
274 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 
271 aa  198  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 
278 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 
269 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 
274 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.72 
 
 
281 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
273 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 
273 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.42 
 
 
277 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.99 
 
 
273 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.78 
 
 
301 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.85 
 
 
266 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.22 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.38 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.96 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
277 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
276 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.48 
 
 
275 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.65 
 
 
275 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.37 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.31 
 
 
255 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
278 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
285 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.96 
 
 
282 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
271 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
272 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
273 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
274 aa  168  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
271 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.34 
 
 
273 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 
271 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
260 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 
275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.98 
 
 
272 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
282 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
278 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
259 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  37.91 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
277 aa  161  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
272 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
272 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 
273 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
280 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.62 
 
 
277 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
264 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  42.58 
 
 
262 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
289 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.01 
 
 
267 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
270 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 
270 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.63 
 
 
262 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
280 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
271 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
270 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.01 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
277 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
268 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
274 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
273 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.93 
 
 
270 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.43 
 
 
277 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
271 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
282 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
275 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.49 
 
 
270 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.94 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
279 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
270 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.32 
 
 
267 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.42 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.93 
 
 
281 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.6 
 
 
274 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
264 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 
274 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
267 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>