More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1570 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
281 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.09 
 
 
270 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.38 
 
 
272 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 
272 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.47 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 
272 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
272 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
272 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.32 
 
 
272 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.01 
 
 
276 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
272 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.94 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.12 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 
274 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
272 aa  231  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 
274 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.03 
 
 
274 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.43 
 
 
276 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
260 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.28 
 
 
272 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.18 
 
 
270 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.04 
 
 
273 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.28 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
265 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 
267 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.42 
 
 
280 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
267 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.26 
 
 
274 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  44.7 
 
 
264 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.32 
 
 
279 aa  215  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 
267 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.41 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.8 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.69 
 
 
270 aa  212  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.64 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.13 
 
 
270 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.49 
 
 
270 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 
271 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.08 
 
 
271 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 
270 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
285 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
269 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
279 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.38 
 
 
269 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
269 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
271 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.17 
 
 
264 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
279 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.91 
 
 
281 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
269 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
275 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
275 aa  204  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
279 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.28 
 
 
282 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.73 
 
 
266 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.76 
 
 
271 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.11 
 
 
264 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.09 
 
 
272 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.38 
 
 
275 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.98 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
268 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.45 
 
 
264 aa  198  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 
270 aa  195  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 
270 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.42 
 
 
276 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.95 
 
 
257 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
273 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.4 
 
 
264 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
268 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>