More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0546 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
275 aa  570  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.94 
 
 
276 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
272 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.32 
 
 
272 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
272 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
273 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
272 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
273 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3719  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
273 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.65 
 
 
274 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1231  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
272 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000109487  normal  0.438718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  221  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
272 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.57 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.45 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.4 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1331  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
272 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 
272 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.24 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
285 aa  218  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.28 
 
 
273 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2861  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.07 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0351901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  40.81 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
272 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 
282 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
273 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.38 
 
 
277 aa  209  5e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
271 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
272 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 
272 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.22 
 
 
277 aa  206  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 
275 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 
272 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
275 aa  205  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
271 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
273 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 
271 aa  202  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1126  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
272 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000450771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.67 
 
 
273 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
274 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
274 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 
274 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
273 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.51 
 
 
282 aa  195  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
285 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
274 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
273 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 
270 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
284 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 
273 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
272 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.92 
 
 
273 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
292 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
289 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
270 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
270 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
270 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 
273 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
271 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.88 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
273 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.55 
 
 
280 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
273 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.6 
 
 
278 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
286 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  39.02 
 
 
262 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.78 
 
 
272 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 
264 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  37.88 
 
 
262 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 
282 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
274 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 
269 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
279 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>