More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3364 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 255 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  98.82 
 
 		 273 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  88.63 
 
 		 273 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  72.38 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.06 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.08 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.75 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.61 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.29 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.92 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.09 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.47 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.95 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.17 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.92 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.53 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.7 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.78 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.95 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.83 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.65 
 
 		 275 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.28 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.28 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.39 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.13 
 
 		 280 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.31 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.98 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.21 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.8 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.58 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.17 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.79 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.33 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.18 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.77 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 273 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.79 
 
 		 275 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.93 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.86 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.78 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.93 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.6 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.46 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.47 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.13 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 		 274 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  37.73 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  37.73 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.7 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.46 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.17 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.15 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.31 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 282 aa  144  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.02 
 
 		 273 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.92 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.09 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.48 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.37 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.09 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.15 
 
 		 270 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.91 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.47 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.2 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.67 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.63 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.08 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.47 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.5 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.02 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.1 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.32 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.99 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>